Efecto del 2-mercaptoetanosulfonato de sodio (MESNA) en la microbiota de pacientes pediátricos con otitis media crónica colesteatomatosa usando la secuenciación del ARNr 16S

Resumen

OBJETIVO: Evaluar los cambios en la microbiota en la otitis media crónica colesteatomatosa posterior a la aplicación de 2-mercaptoetanosulfonato de sodio (MESNA) en población pediátrica, a través de secuenciación de ARN ribosomal bacteriano 16S.

MATERIALES Y MÉTODOS: Estudio subexperimental, prolectivo, efectuado en el Servicio de Otorrinolaringología del Hospital Infantil de México Federico Gómez, Ciudad de México, de diciembre de 2017 a diciembre de 2018. Se incluyeron niños con otitis media crónica colesteatomatosa operados de mastoidectomía primaria o de revisión. Se obtuvo ARN total de colesteatomas (antes y después de la aplicación de MESNA). Se determinó abundancia relativa, riqueza y diversidad a nivel de filo y género.

RESULTADOS: Se incluyeron 26 muestras de 13 niños de uno y otro sexo sin comorbilidades. Se identificó más del 98% de las secuencias en cuanto a filo, clase, orden y familia. La microbiota estuvo representada por los filos predominantes Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria, Cyanobacteria y Bacteroidetes. En cuanto al género se observaron Turicella y Allococcus asociados con la enfermedad. Posterior a la aplicación de MESNA prevalecieron y aumentaron en abundancia los géneros Propionibacteria y Staphylococcus asociados con la microbiota habitual del oído medio. También se observó incremento en la diversidad de bacterias, aumento y surgimiento de otros géneros que forman parte de la microbiota endógena del oído medio.

CONCLUSIONES: El surgimiento y prevalencia de géneros presentes en el microbiota habitual de oído medio sano y la pérdida de géneros patógenos demuestran la utilidad del MESNA.

PALABRAS CLAVE: Otitis media; colesteatoma; MESNA; microbiota; ARNr 16s.

Abstract

OBJECTIVE: To evaluate the changes in the microbiota in the chronic cholesteatomatous otitis media after the application of sodium 2-mercaptoethanesulfonate (MESNA) in the pediatric population, through 16S bacterial ribosomal RNA sequencing.

MATERIALS AND METHODS: A subexperimental, prolective study done at the Otorhinolaryngology service of Hospital Infantil de México Federico Gómez, Mexico City, from December 2017 to December 2018, including children with chronic cholesteatomatous otitis media who underwent primary or revision mastoidectomy. The RNA of cholesteatomas was obtained (before and after MESNA application). Relative abundance, richness and diversity were determined at the level of phylum and genera.

RESULTS: Twenty-six samples were included, corresponding to 13 children of both sexes, without comorbidities. It was possible to identify more than 98% of the sequences at the level of phylum, class, order, and family. The microbiota was represented by the predominant phyla Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria, Cyanobacteria and Bacteroidetes. At the genus level, Turicella and Alloiococcus were observed in association with the disease. Likewise, it was observed that after the application of MESNA, the genera Propionibacteria and Staphylococcus associated with the usual microbiota of the middle ear prevailed and increased in abundance. Similarly, an increase in the diversity of bacteria was observed, as well as an increase and emergence of other genera that are part of the endogenous microbiota of the middle ear.

CONCLUSIONS: The emergence and prevalence of genera present in the normal healthy middle ear microbiota and the loss of pathogenic genus demonstrate the usefulness of MESNA.

KEYWORDS: Otitis media; Cholesteatoma; MESNA; Microbiota; 16s rRNA.